tworzenie struktur

[tymonek584]

Witam!
Bardzo lubię korzystać z programu, a zwłaszcza przeglądać struktury. Mam pytanie: program umożliwia jedynie przeglądanie struktur. Czy jest jakiś sposób, żeby samemu je tworzyć?
Z góry dzięki za pomoc!

[clash]

Witam,

w chwili obecnej moduł umożliwia jedynie przeglądanie struktur. Pracujemy nad możliwością wczytywania plików w formacie *.pdb, których w sieci jest już bardzo dużo. Obecnie tworzenie nowych struktur może się odbywać jedynie przez "ręczne" modyfikowanie plików*.xml.

[tymonek584]

(2011-03-05 22:57)clash napisał(a):  Obecnie tworzenie nowych struktur może się odbywać jedynie przez "ręczne" modyfikowanie plików*.xml.

W jaki sposób to zrobić??

[clash]

Najprościej:

- przejść do katalogu zawierającego struktury (\xml\schematy_struktur_molekularnych),
- skopiować jeden z dostępnych schematów (np. woda.xml) pod inną nazwą (np. schemat.xml),
- otworzyć plik w Notatniku,
- zmodyfikować sekcję informacje do potrzeb nowej struktury (nazwa, autor, opis itp.),
- zmodyfikować sekcję atomy poprzez dodanie lub zmianę nazwy istniejących atomów,
- zmodyfikować sekcję uklad poprzez dodanie nowych atomów oraz ich położenie w przestrzeni trójwymiarowej (x, y, z),
- zapisać plik, a następnie spróbować go wczytać w programie.

Podczas prac nad nowymi schematami można korzystać z klawisza CTRL+R, który powoduje odświeżenie (ponowne wczytanie) struktury, bez konieczności otwierania okna wyboru. W przyszłości chcielibyśmy uprościć tworzenie struktur poprzez wprowadzenie wizualnego edytora.